溶剂清洗剂与水基清洗剂在性质、用途、效果、环保性、经济性方面均存在明显的差别，但因溶剂清洗剂的种类也众多，难以按所有溶剂清洗剂品类细分特点比较，所以以下按溶剂清洗剂与水基清洗剂的普遍性特点来进行比较。

水基清洗剂的清洗机理不仅利用了水本身就是良好的极性溶剂的特点，还通过表面活性剂改变表面张力对有机污垢进行乳化渗透，降低污垢对物体的附着力从而达到洗脱的效果;与溶剂清洗剂相比，水基清洗剂稳定性要差些，在一些条件下乳化渗透能力会发生变化，清洗效果也会受到牵连。在进行大面积清洗时，清洗后基材表面湿滑，存在滑倒安全隐患，同时水基清洗剂挥发性差，隐蔽部位清洗不净，多数情况须用水最后清洗，存在金属锈蚀的隐患。所以在使用水基清洗剂进行清洗时需要保证清洗条件适宜，另外在稍微加热的条件下能够提高清洗效果，不过清洗工艺较为复杂，需要进行多步操作，清洗效果也比溶剂清洗剂要稍差些，但是在安全性和环境影响性以及人体健康方面水基清洗剂都要比有溶剂清洗剂表现得更加友好，在经济成本上也较为低廉，适合普通大众化的清洗作业，不太适合高附加值产品的清洗，废液的处理方面则需要一些特殊处理。

溶剂清洗剂的清洗机理是通过与有机污垢相似相溶的方法让污垢溶解从而剥离物体表面，清洗剂自身的性质较为稳定，不会因为其他某些因素的影响而改变溶解性质，清洗条件温和，工艺流程简单方便，具有很高的清洗效率。部分溶剂清洗剂自身的可燃性、毒性较高对人体的伤害、对环境的染污、限制了它的使用范围如三氯乙烯、三氯乙烷等;但是随着清洗剂厂家的努力也研制出了毒性更低的三氯乙烯替代品和更加环保无毒的碳氢清洗剂解决了相关问题。

综合上述，溶剂清洗剂与水基清洗剂都各有其优缺点，但是由于各个行业清洗对象不同，污垢的性质及沾污程度不同，清洗作业的环境条件不同，清洗后对表面缓蚀或防锈等具体要求也不同。因此，在选择是采用溶剂清洗剂还是水基清洗剂时应对具体条件进行具体分析，择优综合选用。